{"id":23,"date":"2014-12-17T13:19:43","date_gmt":"2014-12-17T13:19:43","guid":{"rendered":"https:\/\/sylphium.com\/edna\/?page_id=23"},"modified":"2024-04-12T14:47:08","modified_gmt":"2024-04-12T14:47:08","slug":"edna","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sylphium.com\/edna\/edna\/","title":{"rendered":"eDNA onderzoek laten uitvoeren"},"content":{"rendered":"\n
\n
Soort specifieke analyse<\/a><\/div>\n\n\n\n
DNA barcoding analyse<\/a><\/div>\n\n\n\n
eDNA Metabarcoding analyse<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n
<\/div>\n\n\n\n

eDNA onderzoek laten uitvoeren door Sylphium zorgt ervoor dat betrouwbare resultaten beschikbaar komen voor uw instantie of bedrijf zonder noodzakelijke kennis van moleculair ecologische technieken. De bemonstering wordt door u zelf uitgevoerd en de verkregen monsters worden opgestuurd naar het laboratorium van Sylphium. De analyses van Sylphium zijn gevalideerd, gepubliceerd en worden uitgevoerd volgens strikte regels<\/a> die zijn opgesteld aan de hand van de NPR 7394<\/a> (Algemene principes bij kwaliteitsborging van moleculairbiologisch onderzoek voor micro-organismen en environmental DNA). Een complete lijst doelsoorten waaruit gekozen kan worden voor onderzoek staat hier<\/a>.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Sylphium heeft een eigen bemonsteringssysteem ontwikkeld waarmee foutloos en betrouwbaar bemonsterd kan worden. De basis van dit bemonsteringsysteem zijn eDNA Dual filter capsules<\/a>. Voor grond en keutelmonsters zijn er eveneens speciale bemonsteringsmaterialen beschikbaar. Alle capsules en materialen voldoen eveneens aan de eisen in NPR 7394<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

\n
\"Kwabaal,<\/a><\/figure>\n\n\n\n
\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n
\"Zwemmersjeuk,<\/a><\/figure>\n<\/figure>\n\n\n\n

Stappenplan eDNA onderzoek<\/h3>\n\n\n\n
Stappen:<\/td>Beschrijving:<\/td>Uitgevoerd door:<\/td><\/tr>
1<\/td>Keuze type eDNA onderzoek<\/td>Opdrachtgever (in overleg Sylphium)<\/td><\/tr>
2<\/td>Bemonsteringstrategie<\/td>Opdrachtgever (in overleg Sylphium)<\/td><\/tr>
3<\/td>Bemonsteren<\/td>Opdrachtgever<\/td><\/tr>
4<\/td>Opsturen naar het lab<\/td>Opdrachtgever<\/td><\/tr>
5<\/td>Analyse<\/td>Sylphium<\/td><\/tr>
6<\/td>Opstellen analyserapport<\/td>Sylphium<\/td><\/tr>
7<\/td>Eindrapportage<\/td>Opdrachtgever<\/td><\/tr><\/tbody><\/table><\/figure>\n\n\n\n

Hieronder staan alle stappen verder uitgelegd.<\/p>\n\n\n\n

Keuze type DNA-onderzoek<\/h3>\n\n\n\n

Tegenwoordig zijn er vele mogelijkheden om met DNA-technieken soorten snel, betrouwbaar en gevoelig te detecteren. Welk type onderzoek nodig is om een bepaalde vraag te kunnen beantwoorden is vaak niet direct duidelijk. Onderstaand tabel geeft een overzicht welk type onderzoek het beste past bij de vraagstelling.<\/p>\n\n\n\n

<\/td>Soort specifiek<\/strong><\/td>Soort identificatie<\/strong><\/strong><\/td>Soortenlijst opstellen<\/strong><\/td><\/tr>
Beschrijving<\/td>Een bepaalde soort heel gevoelig kwantitatief of kwalitatief aantonen.<\/td>Soort identificeren op basis van materiaal van \u00e9\u00e9n individu.<\/td>Semi-kwantitatief een soortenlijst genereren van meest voorkomende soorten in een bepaalde groep.<\/td><\/tr>
Geschikt voor<\/td>Vissen, amfibie\u00ebn, zoogdieren, reptielen, ongewervelden, ziekteverwekkers, planten, bacteri\u00ebn,<\/td>Vissen, amfibie\u00ebn, zoogdieren, reptielen en grotere ongewervelden<\/td>Vissen, bacteri\u00ebn en eukaryoten<\/td><\/tr>
Type monster<\/td>Water, grond, weefselresten en uitwerpselen<\/td>Weefselresten en uitwerpselen<\/td>Water, grond en uitwerpselen<\/td><\/tr>
Analyse<\/td>qPCR<\/a><\/td>Barcoding<\/a><\/td>Metabarcoding<\/a><\/td><\/tr>
Doorlooptijd
Sylphium<\/td>		Binnen 10 werkdagen (spoed mogelijk)<\/td>10 werkdagen<\/td>3 maanden (sneller vaak mogelijk)<\/td><\/tr><\/tbody><\/table><\/figure>\n\n\n\n

Bemonsteringsstrategie<\/h3>\n\n\n\n

De eDNA analysis van Sylphium hebben de hoogst haalbare gevoeligheid (1 molecuul per analyse). De bemonstering heeft dan ook de grootste invloed op de trefkans van de methode.<\/p>\n\n\n\n

Voor een maximale trefkans, zonder kruisbesmetting met eDNA tussen monsters en een goede registratie van monsters dienen de eDNA bemonsteringsregels in acht worden genomen.  Zie sectie monsterneming<\/a>  en de handleiding van de monstername set<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Monsterneming<\/h3>\n\n\n\n

Water, uitwerpselen en grond kunnen worden bemonsterd om specifieke doelsoorten aan te tonen of om de soortensamenstelling te bepalen. Sylphium moleculaire ecologie heeft samplesets ontwikkeld voor verschillende soorten samples. Na bemonstering worden de monsters bewaard in een speciale buffer en kunnen ze bij kamertemperatuur worden bewaard. Zie sectie monsterneming<\/a> voor meer informatie.<\/p>\n\n\n\n

\n